고남표 교수 제1대소장 1982. 3. 1 - 1984. 2. 28

김충만 교수 제2대소장 1984. 3. 1 - 1986. 2. 28

고남표 교수 제3대소장 1986. 3. 1 - 1987. 11. 30

강훈이 교수 제4대소장 1987. 12. 1 - 1988. 11. 30

송상호 교수 제5대소장
양식학과 교수 1988. 12. 1 - 1989. 11. 30

신석우 교수 제6대소장 1989. 12. 1 - 1990. 11. 30

이길수 교수 제7대소장 1990. 12. 1 - 1991. 11. 30

김동수 교수 제8대소장
어업학과 교수 1991. 12. 1 - 1992. 11. 30

이규형 교수 제9대소장
해양학과 교수 1992. 12. 1 - 1993. 11. 30

김연수 교수 제10대소장
수산경영학과 교수 1993. 12. 1 - 1994. 11. 30

이조출 교수 제11대소장 1994. 12. 1 - 1995. 11. 30

추효상 교수 제12대소장
해양학과 교수 1995. 12. 1 - 1997. 2. 28

양한춘 교수 제13대소장 1997. 3. 1 - 1998. 2. 28

정관식 교수 제14대소장
양식학과 교수 1998. 3. 1 - 1999. 1. 31

박춘규 교수 제15대소장
식품공학과 교수 1999. 2. 1 - 2000. 4. 16

윤양호 교수 제16대소장
해양학과 교수 2000. 4. 17 - 2001. 8. 30

신현출 교수 제17대소장
해양학과 교수 2001. 9. 1 - 2003. 2. 28

황두진 교수 제18대소장
수산공학과 교수 2003. 3. 1 - 2004. 3. 31

오명주 교수 제19대소장
수산생명의학과 교수 2004. 4. 1 - 2005. 1. 2

조현서 교수 제20대소장
해양학과 교수 2005. 1. 3 - 2005. 10. 9

이연규 교수 제21대소장
해양학과 교수 2005. 10. 10 - 2006.10. 16

추효상 교수 제22대소장
환경해양학과 교수 2006. 10. 17 - 2008. 10.16

정관식 교수 제23대소장
양식생물학과 교수 2008. 10. 17 - 2009. 5. 11

오명주 교수 제24대소장
수산생명의학 교수 2009. 5. 12 - 2011.09.06

황두진 교수 제25대소장
해양기술학부 교수 2011. 09. 07 - 2013. 08.31

김흥윤 교수 제26대소장
수산생명의학과 교수 2013.09.01 - 2015.08.31

서호영 교수 제27대소장
해양기술학부 교수 2015.09.01 - 2018.05.31